در حوزه علمیه نجف مدارس فکرى متعددی وجود دارد.
کانون این حوزه، مدرسه آیتالله خویی است که عملاً در سیاست دخالت نمیکند و تنها ورود حداقلی و ثانویه به سیاست با محوریت ضرورت و مصلحت در پیش گرفته است. این در حالی است که مدرسه شهید صدر اول و دوم - به عنوان مدارس غیر کانونی - نظر متفاوتتری نسبت به امور سیاسی دارند و خواهان ایفای نقش بیشتری در سیاستاند. در میانه این دو مدرسه نیز مدرسه فکری آیتالله سیستانی قرار دارد که نه همانند استادش خویی از سیاست دوری میجوید و نه همانند دیگر مدارس، خود و دیگر روحانیون را روانه حکومت مینماید.